蘭州市軌道交通有限公司成立于2011年10月10日，注冊資本5億元人民幣，為市政府直屬國有獨資企業，負責組織實施軌道交通的建設、運營和管理及與軌道交通相關資源開發的任務。目前，公司領導機構由黨委、董事會、經理層、工會組成。

公司內設辦公室、黨群宣傳辦公室、紀檢監察辦公室、工會辦公室、企業管理辦公室、人力資源處（黨委組織部）、計劃財務處、合同預算處、總工程師辦公室、規劃技術處、工程管理處、安全質量處、機電設備處、前期工作處、信息中心等15個機構。